دانشگاه شهید بهشتی در مورد حواشی ایجادشده در میزگرد فرهنگی دکتر مسعود پزشکیان، کاندیدای ریاست جمهوری، پیرامون قطع همکاری دانشگاه شهید بهشتی با محمد فاضلی توضیحات ارائه کرد که در بخش‌هایی از آن آمده است:
۱. دکترمحمد فاضلی پس از قطع همکاری از سوی دانشگاه مازندران، تقاضای همکاری با دانشگاه شهید بهشتی داشت که علی رغم مخالفت هیأت اجرایی جذب و با توجه به فضای ایجاد شده برای مسئولان وقت دانشگاه، از تاریخ ۱۳۹۳/۶/۱ همکاری خود به عنوان عضو هیأت علمی را با این دانشگاه آغاز نمود.
۲. وی قبل از حضور در دانشگاه شهید بهشتی به عنوان معاون پژوهشی در مرکز بررسی‌های استراتژیک ریاست جمهوری و همزمان در وزارت تعاون، کارو رفاه اجتماعی به‌عنوان مشاور مشغول به کار بوده‌ که در بدو حضور در دانشکده و در جلسه مصاحبه صلاحیت عمومی سال ۱۳۹۲ توسط اعضای کارگروه مطابق معمول و رویه این جلسات به وی متذکر شدند که حضور تمام‌وقت از شرایط پذیرفتن عضو هیأت علمی در دانشگاه است و به او در خصوص انصراف از سمت معاونت و ادامه فعالیت در آن مرکز تأکید شد. دکتر فاضلی ضمن پذیرش شرط فوق‌الذکر متعهد شد حتی در صورت اصرار رئیس آن مرکز و فشارهای جانبی به محض پذیرش در دانشگاه از سمت خود استعفا داده و از مرکز منفک خواهد شد و به صورت تمام وقت در دانشگاه حضور خواهد داشت ولی به رغم این تعهدات و تذکرات بعدی هرگز از آن مرکز منفک نشده و به فعالیت‌های اجرایی خود در آن مرکز و سایر سازمان‌ها ادامه داد.
(تعداد زیادی نامه مبنی بر مخالفت با اشتغال وی در پرونده نامبرده موجود و قابل ارائه است)
3. با توجه به حضور کمرنگ او در دانشکده و گروه در زمان تمدید قرارداد، از دکتر فاضلی درخواست می‌شود در جلسه مورخ ۱۳۹۴/۷/۱ کارگروه بررسی توانایی علمی دانشکده ادبیات و علوم انسانی حضور یافته و متعهد شود که تمام وقت در دانشکده حضور داشته باشد و از اشتغالات خارج از دانشگاه بکاهد.
4. در جلسه مورخ ۱۳۹۵/۸/۱۶ کمیته تمدید قرارداد، با تمدید قرارداد وی مشروط به حضور منظم و برنامه‌ریزی شده با هماهنگی مسئولان دانشکده موافقت شد.
5. جهت تعیین تکلیف وضعیت استخدامی دکتر فاضلی و با میانجیگری رئیس محترم دانشکده ادبیات و علوم انسانی مبنی بر قول مساعد به حضور منظم در گروه و دانشکده، اعضای محترم هیأت اجرایی جذب در جلسه مورخ ۱۳۹۶/۱۲/۷ با امضای فرم شماره ۲ موافقت نمودند و سرانجام پرونده استخدام پیمانی او به وزارت عتف ارسال شد. مرکز جذب وزارت عتف، تاییدیه پیمانی وی را در تاریخ ۱۳۹۷/۶/۱۲ صادر و به دانشگاه ابلاغ نمود.
6. نامه مورخ ۱۳۹۹/۲/۷ از سوی مدیر امور هیأت علمی دانشگاه به منابع انسانی نشان می‌دهد که آقای فاضلی مشمول هیچ یک از شرایط تمدید قرار داد نمی‌گردد.
7. به رغم این که زمان قانونی برای عضو هیأت علمی پیمانی برای تبدیل وضعیت به رسمی آزمایشی پنج سال است اما پس از گذشت هفت سال از همکاری آقای فاضلی با دانشگاه، پرونده تبدیل وضعیت استخدامی وی از پیمانی به رسمی آزمایشی طی نامه شماره ۳۵۲ مورخ ۱۳۹۹/۴/۱۶ از سوی دانشکده به مدیریت امور هیأت علمی ارسال شد تا فرآیند تبدیل وضعیت از جمله ارزیابی کارگروه صلاحیت عمومی و طرح در هیأت جذب دانشگاه انجام گیرد.