سیدمحمود میرلوحی، معاون وزیر کشور دولت اصلاحات از همسو نبودن برخی استانداران و فرمانداران با دولت گلایه کرد. میرلوحی به ایلنا گفته است که طبق قراری که بین وزیر کشور و مجلس گذاشته شده متاسفانه نمایندگان بیش از گذشته در تعیین مدیران سیاسی در استان‌ها اعمال نظر می‌کنند. او معتقد است که نقش نمایندگان در تعیین استانداران پررنگ شده است. حتی به گفته او برخی استانداران هم از این روند ناراضی هستند. به اعتقاد میرلوحی، بخش قابل توجهی از فرمانداران و مدیران سیاسی دولت قبل در استان‌ها در سمت خود باقی مانده‌اند آن هم بدون این‌که سیاست‌های دولت جدید را پذیرفته باشند. میرلوحی معتقد است که باید از تریبون دستگاه‌هایی که امکاناتی برای خود دارند صدای بی‌طرفی شنیده شود نه این‌که در عرصه‌های مهم سیاسی برای جناح خاصی میدان‌داری کنند. «من اطلاع دارم که از سوی دولت به برخی از این دستگاه‌ها نامه‌‌هایی ارسال شده و طی آن از این دستگاه‌ها درخواست شده تا بیش از علایق جناحی‌شان بی‌طرفی خود را ابراز کنند. بازتاب این سیاست دولت باید در استان‌ها هم خود را نشان دهد. استانداران، فرمانداران و به‌طورکلی مدیران سیاسی باید همواره در رفتار و گفتار بی‌طرفی و همسویی با بدنه دولت را از خود نشان بدهند و اینطور نباشد که مثل گذشته از جناحی به‌عنوان اصل انقلاب و از جناح دیگر به‌عنوان غریبه تعبیر شود».