سازمان انرژی اتمی ایران در واکنش به گزارش مدیرکل آژانس بین‌المللی انرژی اتمی اعلام کرد که همه فعالیت‌های هسته‌ای ایران مطابق مقررات بین‌المللی، به‌طور کامل اعلام شده و تحت نظارت مستمر آژانس قرار دارد. این نهاد تأکید کرد که تاکنون هیچ مدرک معتبری مبنی بر وجود خطر اشاعه از موضوعات مطرح‌شده ارائه نشده است.
در این بیانیه آمده است ایران با همکاری نهادهای امنیتی، بررسی‌های دقیقی در خصوص منشأ ذرات اعلام‌شده انجام داده و اخیراً شواهدی به‌دست آمده که نشان می‌دهد ممکن است اقداماتی خرابکارانه یا خصمانه در کار بوده باشد.سازمان انرژی اتمی همچنین نسبت به گنجاندن برخی مسائل حاشیه‌ای و غیرمرتبط در گزارش آژانس انتقاد کرده و آن را مغایر با بی‌طرفی و حرفه‌ای‌گری مورد انتظار از این نهاد بین‌المللی دانست. ایران تأکید کرده که غنی‌سازی ۶۰ درصدی بر پایه مقررات ان‌پی‌تی ممنوع نیست و تمامی ذخایر و فعالیت‌های مرتبط نیز در چارچوب شفاف‌سازی و راستی‌آزمایی آژانس قرار دارند.