محمدرضا مشکیان در ‌سال 1301 در محله گازرگاه شهر یزد چشم به جهان گشود. وی قرآن و دیوان حافظ را در مکتب آموخت. سپس دوره ابتدایی تا سیکل و اول تحصیلات متوسطه را در یزد گذراند. آنگاه برای ادامه تحصیل به دبیرستان سن لویی تهران و دبیرستان مروی رفت و در 1319 هـ .ش دیپلم گرفت.  سپس در رشته حقوق دانشگاه تهران ادامه تحصیل داد. وی از همدوره‌های مرحوم دکتر عبدالحسین زرین‌کوب بود. از استادان وی می‌توان ملک‌الشعرای بهار، لطفعلی صورتگر، عباس اقبال و محمد معین را نام برد.
مرحوم مشکیان پس از این‌که یک‌سال در رشته حقوق تحصیل کرد، تغییر رشته داد و رشته فلسفه را نزد استادانی چون فاضل تونی و یحیی مهدوی دنبال کرد.
او پس از فراغت از تحصیل به استخدام شرکت نفت درآمد و با تشکیل اتحادیه، دست به مبارزه سیاسی علیه استعمار انگلستان و همراهی با نهضت ملی‌شدن صنعت نفت ایران زد و پس از اعتصاب در ‌سال 1325 در شرکت نفت، به خوزستان تبعید شد. سپس در اداره آموزش و پرورش استخدام شده و در شهر‌های خرم‌آباد، کردستان، تهران و یزد به تدریس پرداخت تا در‌ سال 1358 بازنشست شد.
همکاری در تأسیس و اداره مرکز یزدشناسی؛ مدیریت بنیاد خیریه یزد؛ تأسیس و مدیریت دبیرستان خصوصی «آینده یزد»؛ مدیریت دبیرستان ماندگار «ایرانشهر»؛ عضو انجمن تربیت‌بدنی؛ شورای برنامه‌ریزی فرهنگ یزد؛ معاون اداره فرهنگ یزد؛ عضو انجمن آثار و مفاخر فرهنگی و انجمن ایران‌شناسی شعبه یزد؛ ریاست انجمن ادبی کتابخانه مرحوم وزیری یزد و مدیریت کانون بازنشستگان کشوری یزد ازجمله فعالیت‌های اجتماعی ماندگار این پیشکسوت فرهنگ و ادب یزد است.
مرحوم استاد مشکیان که در طول عمر پربار خود همواره مورد احترام همه جریانات سیاسی، اجتماعی و فرهنگی استان یزد و کشور بود، سرانجام بعد از بیش از نیم قرن ارایه خدمات فرهنگی به دارالعباده و دارالعلم یزد، 6 مرداد ‌سال 1391 در 90 سالگی بدون آن‌که دچار عارضه افتادگی شود در بیمارستان مرتاض یزد بر اثر کهولت سن درگذشت و پیکر پاکش در قطعه مفاخر آرامگاه خلدبرین یزد آرام گرفت.
برخی از فعالیت‌های استاد مشکیان:  
معاون اداره آموزش و پرورش یزد
موسس بنیاد خیریه یزد (بنیاد یزد)
موسس و مدیر بنیاد یزدشناسی
عضو انجمن مفاخر استان یزد
رئیس انجمن ادبی کتابخانه مرحوم وزیری یزد
مدیر کانون بازنشستگان کشوری