گروه ورزش|  قضاوت مشکوک علیرضا فغانی در دیدار استقلال و سپاهان بدجوری آبی‌پوشان پایتخت را شاکی کرده است.  استقلالی‌ها در مصاحبه‌های اخیر خود بارها فغانی را عامل شکست تیم خود مقابل سپاهان دانستند و حالا با گذشت چند روز از مسابقه سوم خود در لیگ در اقدامی جالب از بهترین داور فوتبال ایران شکایت کرده‌اند؛ شکایتی که بعید است به جایی برسد و باعث محرومیت یا جریمه برای این داور شود.  علیرضا فغانی اما نظر شخصی‌اش درباره اعتراض استقلالی‌ها این است که هر کسی آزاد است تا درباره مسائل مختلف اظهارنظر کند.  او به «شهروند» می‌گوید: «طبق قانون فیفا داوران نمی‌توانند درباره آخرین مسابقه‌ای که قضاوت کرده‌اند، صحبت کنند و من نیز دوست ندارم حرفی بزنم اما لازم است بگویم که من سعی کردم حق به حق‌دار برسد و در جریان بازی استقلال و سپاهان هم کم‌کاری نکردم.» او اینطور به شکایت باشگاه استقلال واکنش نشان می‌دهد:  «من متن کامل شکایت استقلالی‌ها را دیدم؛ آنها نظرشان این بوده و از نظر من مختارند که شکایت کنند. هرکسی نظری دارد و آزاد است درباره مسائل صحبت کند.» این داور درباره صحنه پنالتی که استقلالی‌ها روی آن معترضند، عنوان می‌کند: «من سعی کردم بهترین تصمیم را بگیرم و الان هم فکر می‌کنم تصمیمم درست بود.  اگر باز هم آن صحنه اتفاق بیفتد، اعلام پنالتی می‌کنم چون نظرم خطا بود.»
وی دراین‌باره که آیا گزارشی بابت مشاجرات رخ‌داده در خلال بازی بین خودش با بازیکنانی همچون خلیل‌زاده یا حیدری یا جر و بحثی که با امیر قلعه‌نوعی و کریم بوستانی لب خط داشت به کمیته داوران داده یا نه، بیان می‌دارد:  «البته که گزارش داده‌ام.  این روال کار ماست که در پایان هر دیدار گزارشی مبسوط از اتفاقات آن بازی را به کمیته داوران ارایه دهیم.» فغانی با بیان این جملات صحبت‌هایش را به پایان می‌برد: «شنیدم باشگاه استقلال موضوعی را مطرح کرده که فغانی عمدا به ضرر این باشگاه سوت می‌زند. این مسائل واقعا زیبا نیست و همین ادعاهای پوچ است که فوتبال ایران را به قهقرا می‌برد.»